Mobile Suit Gundam GQuuuuuuX

女子高生アマテは運び屋のニャアンと出会い、非合法のジャンク屋と関わってしまう。赤いガンダムの捕縛を試みる軍警察の横暴を目にしたアマテは、最新鋭モビルスーツ・ジークアクスに飛び乗る。

一年戦争の最中、ジオン公国軍のエースパイロットであるシャアは、地球連邦軍のモビルスーツ"ガンダム"をサイド7でろ獲。結果、戦局は大きく動き、一年戦争をジオンの勝利へと導いていくが...。

非合法なモビルスーツ決闘競技"クランバトル"に、半ば強引に誘われるアマテ。赤いガンダムを操縦していた少年シュウジと出会ったアマテは、ふたりでクランバトルに出場することを提案する。

ジャンク屋を訪ねてきた女性シイコ・スガイは、魔女の異名を持つ撃墜王だった。因縁の敵である赤いガンダムと決着をつけるためクランバトルにエントリーする魔女の執念に、マチュは圧倒される。

クランバトルで賞金を稼ぎ、シュウジ、ニャアンと地球へ行こうと計画するマチュ。だがクランバトル当日、マチュはエグザベに見つかり身動きがとれなくなってしまう。その時ニャアンは...。

シュウジの隠れ家を見つけたアンキーは、クランバトルの賞金よりも高い赤いガンダムの情報を、クランバトル開催中に売ろうと画策。一方、地球連邦軍情報部はキシリアの極秘情報をキャッチする。

アンキーの計画を知り、シュウジを逃がすためクランバトルを利用した一計を案じるマチュとニャアン。だがクランバトルの対戦相手は、キシリア暗殺を狙うテロリストの新型モビルアーマーだった。

一年戦争末期、地球連邦軍によるソロモン要塞落下作戦を阻止し、月面都市グラナダを守るべく、シャア率いるソドン艦隊が出撃。その5年後、グラナダにはキシリアとともにニャアンの姿があった。

謎のメッセージに導かれ、ジークアクスで地球に降下するマチュ。不時着したマチュを助けたのはカバスの館にとらわれた女性だった。マチュは彼女を連れ出しコア・ファイターで脱出しようとする。

イオマグヌッソの破壊活動を止めるため、シャリア・ブルの依頼で薔薇(ばら)の少女を救い出そうとするマチュ。だがキシリアの命を受けたニャアンが、ひと足先にゼクノヴァ砲を動かそうとする。